Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RarbP22605 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RarbP22605 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RarbP22605 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RarbP22605 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RarbP22605 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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