Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms