Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms