Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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