Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms