Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms