Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms