Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PolP10400 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PolP10400 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PolP10400 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PolP10400 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PolP10400 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PolP10400 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PolP10400 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PolP10400 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PolP10400 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PolP10400 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PolP10400 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PolP10400 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PolP10400 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PolP10400 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PolP10400 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms