Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl1P10146 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl1P10146 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl1P10146 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl1P10146 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl1P10146 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl1P10146 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl1P10146 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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