Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms