Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Me1P06801 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Me1P06801 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Me1P06801 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Me1P06801 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Me1P06801 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Me1P06801 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Me1P06801 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Me1P06801 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Me1P06801 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Me1P06801 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Me1P06801 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Me1P06801 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms