Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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