Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GzmbP04187 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GzmbP04187 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms