Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms