Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CrxO54751 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms