Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FxnO35943 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms