Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Clk2O35491 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Clk2O35491 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Clk2O35491 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Clk2O35491 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Clk2O35491 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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