Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc27a2O35488 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms