Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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