Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms