Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Barx2O08686 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx2O08686 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx2O08686 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx2O08686 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Barx2O08686 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx2O08686 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx2O08686 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx2O08686 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx2O08686 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx2O08686 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx2O08686 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Barx2O08686 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx2O08686 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx2O08686 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx2O08686 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms