Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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MttpO08601 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MttpO08601 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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MttpO08601 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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MttpO08601 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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MttpO08601 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MttpO08601 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MttpO08601 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms