Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltaO08585 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltaO08585 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltaO08585 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltaO08585 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltaO08585 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltaO08585 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltaO08585 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltaO08585 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltaO08585 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltaO08585 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltaO08585 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltaO08585 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltaO08585 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltaO08585 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltaO08585 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltaO08585 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltaO08585 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltaO08585 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltaO08585 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltaO08585 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltaO08585 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms