Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3239L7N2D9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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