Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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