Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms