Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms