Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm28051J3QMA2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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