Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm3727J3QM54 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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