Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms