Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms