Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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