Protein–RNA interactions for Protein: F8WIA3

Gm20604, Predicted gene 20604, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20604F8WIA3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 AC168276.1-201ENSMUST00000218963 2385 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm20604F8WIA3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm20604F8WIA3 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms