Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 A430046D13Rik-201ENSMUST00000180477 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms