Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms