Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm28305F6U473 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm28305F6U473 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm28305F6U473 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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