Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms