Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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