Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms