Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20518E9Q548 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20518E9Q548 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20518E9Q548 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20518E9Q548 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20518E9Q548 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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