Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms