Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms