Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms