Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3298E9PW80 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3298E9PW80 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms