Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc17E9PVB5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms