Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms