Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms