Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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