Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms