Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms